Постановлением Совета Министров СССР N 4551-1801/CC/ОП от 24 ок¬тября 1952 года создана УТЧ-2 (Учебно-тренировочная часть), при которой Директивой Министра обороны СССР N 1626587 от 6.11.1952 г. сформи¬рована войсковая часть 32396.
 
Директивой Главнокомандующего Восками ПВО страны от 19 октября 1960 года № ОМУ/1/455510 определен штат и порядок формирования 355 гарнизонной поликлиники (при войсковой части 32396) для обслуживания личного состава, офицеров и членов их семей управления 1 Армии ПВО ОсН и частей гарнизона Северный. Поликлиника была сформирована и укомплектована согласно штатного расписания 30.11.1960 года.
 
Приказом по 355 поликлинике № 1 от 18.12.1960 года вступил в обязанности начальника поликлиники майор медицинской службы ГОЛДА Пантелеймон Филиппович (по 24.11.1964 г.). Строительство здания поликлиники завершено в мае 1961 года. Приказом командира войсковой части поликлиника введена в состав медицинского отдела войсковой части 32396 и приступила к работе.
 
За высокие показатели в лечебно-профилактической работе в 1966 году поликлинике присвоено звание «Учреждение высокой культуры труда», в 1970 году — «Коллектив коммунистического труда».
 
С 1 декабря 1986 года поликлиника переведена на штат 27/822(52), введенном в действие с 1 августа 1986 года и перечню изменений к штату, численностью личного состава 83 чел. (19 военнослужащих, 64 граж-данского персонала), мощностью 25 тыс. посещений в год.
 
В связи с проведением организационно-штатных мероприятий в 1 Армии ПВО поликлиника выведена из подчинения войсковой части 32396 и включена в состав медицинской службы Московского округа ПВО.
 
В 1997 году поликлиника была лицензирована (30 декабря) и начала работать в системе обязательного медицинского страхования и оказания платных медицинских услуг.
 
С 1 января 1998 года в связи с реорганизацией Московского округа ПВО, поликлиника включена в состав медицинской службы Московского ок¬руга ВВС и ПВО Военно-Воздушных Сил.
 
С 2008 года поликлиника работала в статусе ФГУ «355 поликлиника Командования специального назначения» и содержалась в штате 27/069-51, введенном в действие с 1 августа 2006 года.
 
Во исполнение приказа Министра обороны Российской Федерации от 26 февраля 2010 г. № 115 поликлиника реорганизована путем присоединения к ФГУ «1586 ОВКГ МВО» в форме структурного подразделения.
 
В соответствии с директивами Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации от 13 июля 2010 года № 314/6/2544, Главного военно-медицинского управления Министерства обороны Российской Федерации от 29 июля 2010 года № 161/1/1/6833, приказа начальника Главного военно-медицинского управления Министерства обороны Российской Федерации от 12 августа 2010 года № 139 поликлиника (мкр. Северный, г. Балашиха, Московской области) 01.11.2010 г. включена в состав филиала № 6 ФГУ «Главный военный клинический госпиталь имени академика Н.Н. Бурденко МО РФ»
 
С 1 сентября 2013 года поликлиника № 2 включена в состав филиала № 1 ФГКУ «ГВКГ им. Н.Н. Бурденко» Минобороны России с исключением из состава филиала № 6 ФГКУ «ГВКГ им. Н.Н Бурденко» Минобороны России.
 
В соответствии с приказом Министра обороны Российской Федерации от 30 декабря 2016 г. № 861, указаний начальника Генерального штаба ВС РФ от 16 января 2017 г. № 314/6/178, приказом начальником ФГКУ «ГВКГ им. Н.Н Бурденко» Минобороны России, от 14 марта 2017 г. № 42, приказом начальника филиала № 1 ФГКУ «ГВКГ им. Н.Н. Бурденко» Минобороны России от 20 марта 2017г. № 34 поликлиника реорганизована и введена в штат ФГБУ « 12 Консультативно-диагностический Центр» Минобороны России.